北大科研團隊及合作者發(fā)現(xiàn)新冠病毒存在兩個主要譜系

中國教育報—中國教育新聞網(wǎng)訊（記者 柴葳 通訊員 陳振云）近日，由中國科學院主辦的英文綜合性期刊《國家科學評論》發(fā)表了由北京大學生命科學學院陸劍課題組和中國科學院上海巴斯德研究所崔杰課題組合作撰寫的論文《SARS-CoV-2的起源與持續(xù)進化》，對新冠病毒基因組的演化動態(tài)進行深入研究和解讀。該研究最早提出了新冠病毒存在兩個主要譜系，從基因組水平上加深了我們對這種新型病毒的認識，對新冠肺炎疫情的臨床診斷具有重要參考價值。

論文發(fā)表后迅速引起了國內(nèi)外學界和媒體的熱切關注，據(jù)《國家科學評論》官方網(wǎng)站數(shù)據(jù)顯示，論文發(fā)表至今閱讀量已經(jīng)排在了該雜志所有文章閱讀量的榜首，被下載8.8萬多次。

陸劍研究員及其課題組在基因組和分子演化領域經(jīng)驗豐富，并有一系列重要研究成果，尤為擅長從RNA水平上研究基因表達調(diào)控的機制和進化規(guī)律?！爸挥辛私獠《?，才能更好地找到快速診斷、嚴密防御和有效治療病毒感染的措施，”陸劍說，“開展這項研究也是在抗‘疫’期間我嘗試的教學改革，以培養(yǎng)學生分子進化和基因組學方面的分析能力?！?/p>

陸劍課題組與崔杰課題組合作，通過對新冠病毒和近緣病毒進行系統(tǒng)發(fā)生分析，發(fā)現(xiàn)新冠病毒雖然與蝙蝠冠狀病毒RaTG13的基因組總體差異較小（~4%），但其基因組內(nèi)中性進化位點的差異高達17%，表明新冠病毒在進化過程中經(jīng)歷了非常強的自然選擇。通過對新冠病毒和來自馬來穿山甲的冠狀病毒的核苷酸比較，推測新冠病毒與其分歧事件并非近期發(fā)生，也說明新冠病毒的起源可能更為復雜。

“我們當時進行這項研究的時候，公共數(shù)據(jù)庫中只有103個新冠病毒基因組序列，而經(jīng)過我國及其他國家科學家和醫(yī)務工作者一致努力，到3月底基因組序列增加到2225個，截至5月2日基因組序列已經(jīng)超過15000多條。”陸劍課題組基于這15000多條基因組序列進行了進一步分析發(fā)現(xiàn)，“我們當時根據(jù)103個基因組序列把新冠病毒分為L和S兩個譜系，現(xiàn)在基因組數(shù)據(jù)增大一百多倍后，L和S譜系的劃分仍然非常明確，而且在世界不同國家和地區(qū)的分布也呈現(xiàn)不同，下一步我們還要連點成線，并結合臨床數(shù)據(jù)和流行病學結果開展深入研究?！?/p>